深圳市保健办为市保健委员会下设的干部医疗保健工作管理机构，为副局级单位。位于深圳市东门北路1019号大院，医疗建筑面积6000平方米。现有高级职称的医学专家和工作人员200余人 。
保健办的主要职责：一、贯彻执行中央、省、市保健委员会的各项决议，管理和协调全市干部医疗保健、健康体检、干部疗养和办证、经费审批等工作；二、负责来深中央首长及外宾的医疗保健；三、负责市一、二、三级保健对象的医疗保健；四、承担市委、市政府、人大、政协、纪委和国际性大型会议的医疗保健任务。
保健办下设的医疗保健业务部门有：专家门诊部、体检部、保健部、审批科。建立了全市保健对象的健康资料计算机管理信息中心和体检信息中心，实现了现代化的科学管理。
深圳市委市政府高度重视干部医疗保健工作，认真贯彻中央领导同志关于干部保健工作的一系列指示，落实中央保健委员会的部署，不断加大干部医疗保健工作的力度，在政策和财力上大力支持，使深圳市的干部医疗保健工作与时俱进，呈现了新的面貌。
深圳市保健办专家门诊部和体检部是专为保健对象服务的医疗保健机构，是深圳市医保定点医疗单位。根据上级的指示精神，为了贯彻江总书记“三个代表”的思想，为充分利用卫生资源，改善深圳投资环境和提高人民健康水平，新建专家门诊部后座对社会开放。市民可以在这里享受到高质量的一流的医疗保健服务。